MEJORAMIENTO ANIMAL TALLER PRÁCTICO #1 MARIA ALEJANDRA RODRIGUEZ ALEY GRUPO: 201108_9 UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A
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MEJORAMIENTO ANIMAL TALLER PRÁCTICO #1
MARIA ALEJANDRA RODRIGUEZ ALEY GRUPO: 201108_9
UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA ESCUELA DE CIENCIAS AGRICOLAS, PECUARIAS Y DEL MEDIO AMBIENTE CEAD - FLORENCIA 2019
Guía para el desarrollo del componente práctico Taller No. 1 Actividades a desarrollar Materiales a) b) c) d)
Trozos de papel cortados en cuadrados pequeños de color rojo y azul Tijeras Bolsa Calculadora o computador
I.
Actividad práctica inicial
El objetivo de esta actividad es entender la dinámica de la genética poblacional y la importancia de la genética cuantitativa al mejoramiento animal. Para entender las fuerzas que afectan las poblaciones y cómo se modifican las frecuencias alélicas de las mismas debido a dichas fuerzas, construya una población a partir de alelos seleccionados al azar, para ello:
1.1.
Cada grupo de estudiantes, debe construir una población hipotética de individuos. Para ello tome una hoja de papel rojo y otra hoja de color azul y construya cuadritos de aproximadamente un centímetro de área por cada uno, de manera que obtenga 50 cuadritos de color rojo y 50 de color azul, colóquelos en una bolsa. Imagine que los papeles rojos son los gametos masculinos y los de color azul los gametos femeninos, tomando al azar de la bolsa, cada vez, construya una población de 50 individuos, uniendo dos gametos al azar, simulados por los papeles rojos y azules y teniendo en cuenta lo siguiente: Dos cuadritos rojos corresponden a un homocigoto AA Un cuadrito rojo y uno azul, corresponden a un heterocigoto Aa Dos cuadritos azules corresponden a homocigotos aa Realice una prueba de hipótesis de Chi- cuadrado para determinar, sí la población se encuentra en equilibrio de Hardy-Weinberg.
Nota: Cada vez que realice la extracción de los cuadritos de la bolsa identifique el individuo, anote el genotipo en una tabla, de acuerdo con los colores planteados. Vuelva el papel a la bolsa, mezcle bien y repita el procedimiento anotando los resultados en una tabla como la siguiente:
Tabla No. 1 Población hipotética Individuo
Genotipo
1
AA
2
Aa
3
AA
4
Aa
5
AA
6
Aa
7
Aa
8
aa
9
AA
10
AA
11
Aa
12
Aa
13
AA
14
AA
15
Aa
16
Aa
17
Aa
18
aa
19
AA
20
AA
21
Aa
22
AA
23
Aa
24
aa
25
aa
26
AA
27
aa
28
aa
29
Aa
30
aa
31
Aa
32
Aa
33
aa
34
Aa
35
AA
36
Aa
37
aa
38
aa
39
Aa
40
Aa
41
Aa
42
AA
43
Aa
44
aa
45
Aa
46
aa
47
AA
48
aa
49
Aa
50
Aa
Luego cuente los individuos y realice una tabla como la siguiente: Tabla No. 2. Genotipos Genotipos
AA
Aa
aa
No. de individuos
14
22
14
Con base en los resultados de la tabla No 2: a) Con ayuda de su profesor construya el concepto de Equilibrio de Hardy- Weinberg. b) Calcule las frecuencias genotípicas, la frecuencia del gen A y a.
F(A)= (14 + 22/2) / 50 = 0,50: p F(a)= (14+22/2) / 50 = 0,50: q
c) Determine las frecuencias de los individuos en equilibrio de Hardy- Weinberg.
AA= P2 = (O,50)2 = 0,25 Aa=2pq=2 x (0,50 x 0,50) = 0,50 aa=q2 (0,50)2 =0,25
p2+2pq+q2 = 1 (0.50)2+ 2(0.50) (0.50) + (0.50)2= 1 (0.25) + (0.5) + (0.25) = 1
II.
Tome la población total de papelitos y colóquelos sobre una superficie plana, pase por encima de ellos un papel para film y retírelo o simplemente sóplelos y reduzca el tamaño de la población al azar. Allí debieron quedar muchos de los papelitos iniciales, colóquelos nuevamente en la bolsa y realice una nueva población de 20 individuos, nuevamente calcule las frecuencias genéticas y alélicas. Realice las conclusiones respectivas. Realice los siguientes ejercicios:
Individuo
Genotipo 1
aa
2
Aa
3
aa
4
AA
5
Aa
6
AA
7
AA
8
aa
9
aa
10
Aa
11
AA
12
Aa
13
Aa
14
AA
15
Aa
16
Aa
17
aa
18
AA
19
AA
20
aa
Genotipos
AA
Aa
aa
Nª de individuos
7
7
6
-las frecuencias genotípicas, la frecuencia del gen A y a. F(A)= (7+7/2) /20 = 0.525 p F(a)= (6+7/2) /20= 0.475 q
-las frecuencias de los individuos en equilibrio de Hardy- Weinberg. p2+2pq+q2 = 1 (0.525)2 + 2 (0.525) (0.475) + (0.475)2 = 1 (0.2625) + (0.5) + (0.2375) = 1
2.0. Organice grupos de cuatro estudiantes y realice la lectura de las siguientes entrevistas publicada en el portal de la Organización de las Naciones Unidas para la Agricultura y la Alimentación (FAO) que trata la importancia de la mejora genética animal para combatir enfermedades en especies domésticas y Peligra la diversidad genética de los animales de granja, las cuales puede encontrar en los siguientes links: a. https://historiaybiografias.com/seleccion_artificial/ b. http://www.fao.org/ag/esp/revista/0011sp2.htm Cada grupo debe formular 5 preguntas respecto a la lectura, como si fuera el entrevistador, luego entrega los diferentes grupos deben realizar las preguntas a otros grupos y contestarlas. 2.1.
Usted tiene una muestra de una población en donde usted tiene el porcentaje de genotipos homocigotos recesivos de 26%. Utilice esta información para calcular las siguientes frecuencias: A. B. C. D.
La frecuencia del genotipo aa La frecuencia del alelo a La frecuencia del alelo A Las frecuencias de los genotipos AA y Aa
Genotipos
AA
Aa
aa
Nª de individuos
48
26
26
F(A)= (48+26/2) / 100 = 0.61 p F(a) = (26+26/2) / 100 = 0.39 q y (p,q) = 1
2.2.
Indague la manera en que se realiza un pedigree, una vez entendida la manera, resuelva los siguientes puntos:
a. Construya el pedigree de su familia. Incluya al menos tres generaciones.
Ricardo Rodríguez
Elodia vega
Israel Rodríguez vega
Cornelio Ramírez
María del Carmen barón
José Antonio López
Pastora López
Herminia López López
Rosana Ramírez barón
Fred Rodríguez Ramírez
Carlos julio Aley
Luis Carlos Aley Esquivel
Martha Aley López
María Alejandra Rodríguez Aley
b. Usted es criador de perros y tiene la siguiente genealogía. Un macho llamado Odie, con genotipo CD, el cual se aparea con Lassie (genotipo AB) y Lola (genotipo EF). Con Lassie, tiene un descendiente llamado Jim (genotipo AC) y con Lola un descendiente llamado Gina (genotipo CF), Jim y Gina se aparean y tienen a Donald (genotipo CC). Co base en esta información diagrame el árbol genealógico de Donald, siga el alelo C a través de las generaciones e indique porque Donald sufre susceptibilidad a Leishmania.
Justina Esquivel
ODIE CD
LASSIE
LOLA
AB
EF
JIM
GINA
AC
CF
DONALD CC
La Leishmania (parasito) que sufre Donald fue heredado por pate materna y paterna. Ya que su abuelo estaba contagiado.
2.3.
Con los datos de la tabla No. 4, calcule el promedio, la desviación estándar y la varianza de los siguientes valores correspondientes a producción de leche por lactancia y porcentaje de grasa en vacas Holstein (tomado de Quijano y Echeverri, 2015. Genética cuantitativa aplicada al mejoramiento animalEditorial Universidad Nacional de Colombia). Realice el análisis y las conclusiones respectivas.}
2.4.
Indague sobre los siguientes conceptos, sea breve y conciso en su respuesta: a. Estadística descriptiva, medidas de tenencia central, hipótesis, prueba de hipótesis, Error tipo I y tipo II. Tabla No. 4. Producción de leche y porcentaje de grasa en vacas Holstein
VACA NO.
PRODUCCIÓN DE LECHE POR LACTANCIA (KG)
% DE GRASA
1
8600
3
2
6890
3
3
7456
2.9
4
8900
3.1
5
8765
3.2
6
8200
3
7
6890
3.3
8
7500
3.4
9
8300
3.3
10
6890
3.3
11
6900
3.2
12
7900
3.2
13
5350
3.5
14
6908
3.3
15
6543
3.4
16
7432
3.4
17
6243
3.3
18
6900
3.4
19
6211
3.5
20
6432
3.6
21
6387
3.5
22
5254
3.4
23
6098
3.6
24
5490
3.4
Calculo del promedio: Promedio producción de leche por lactancia (kg):
Producción de leche por lactancia (kg) 8600 6890 7456 8900 8765 8200 6890 7500 8300 6890 6900 7900 5350 6908 6543 7432 6243 6900 6211 6432
6387 5254 6098 5490 ∑
168.439/24 = 7.018,29
Promedio producción de leche por lactancia (kg): 7.018,29 kg
Calculo del promedio: Promedio % de grasa:
% de grasa 3 3 2.9 3.1 3.2 3 3.3 3.4 3.3 3.3 3.2 3.2
3.5 3.3 3.4 3.4 3.3 3.4 3.5 3.6 3.5 3.4 3.6 3.4 ∑
79.2/24 = 3.3%
Promedio % de grasa: 3.3 %
Calculo de la varianza: Calculo varianza producción de leche por lactancia (kg): ẋ
xi
Donde n es el tamaño de la población: 24 y ẋ = Promedio producción de leche por lactancia (kg): 7.018,29 kg
Producción de leche ẋ - xi por lactancia (kg) Xi
( ẋ-xi)²
8600
-1581.71
2501806.524
6890
128.29
16458.3241
7456
-437.71
191590.0441
8900
-1881.71
3540832.524
8765
-1746.71
3050995.824
8200
-1181.71
1396438.524
6890
128.29
16458.3241
7500
-481.71
232044.5241
8300
-1281.71
1642780.524
6890
128.29
16458.3241
6900
118.29
13992.5241
7900
-881.71
777412.5241
5350
1668.29
2783191.524
6908
110.29
12163.8841
6543
475.29
225900.5841
7432
-413.71
171155.9641
6243
775.29
601074.5841
6900
118.29
13992.5241
6211
807.29
651717.1441
6432
586.29
343735.9641
6387
631.29
398527.0641
5254
1764.29
3112719.204
6098
920.29
846933.6841
5490
1528.29
2335670.324 24894050.96
⇒ ⇒ ⇒
ẋ .
1.082.350 Varianza en la producción de leche.
Calculo varianza en el % de grasa: ẋ
xi
Donde n es el tamaño de la población: 24 y ẋ = Promedio del % de grasa: 3.3%
Producción de leche por ẋ - xi lactancia (kg) Xi
( ẋ-xi)²
3
0.3
0.09
3
0.3
0.09
2.9
0.4
0.16
3.1
0.2
0.04
3.2
0.1
0.01
3
0.3
0.09
3.3
0
0
3.4
-0.1
0.01
3.3
0
0
3.3
0
0
3.2
0.1
0.01
3.2
0.1
0.01
3.5
-0.2
0.04
3.3
0
0
3.4
-0.1
0.01
3.4
-0.1
0.01
3.3
0
0
3.4
-0.1
0.01
3.5
-0.2
0.04
3.6
-0.3
0.09
3.5
-0.2
0.04
3.4
-0.1
0.01
3.6
-0.3
0.09
3.4
-0.1
0.01 0.86
ẋ
⇒ ⇒ ⇒
.
0.03739 Varianza en el porcentaje de grasa.
Análisis El promedio de la producción de leche por lactancia es de 7.018,29 Kg, donde 9 individuos están por encima del promedio y 15 están por debajo; nos indica que solo 60% de la producción tiene un nivel por encima de la media. En este caso hay que investigar los posibles factores que afectan el 40% restante de la población. En el caso de la varianza, que es de 1.082.350 nos permite visualizar que están muy dispersos los datos alrededor de la media, indica que hay variabilidad en los datos. El promedio en el % de grasa es de 3.3%, donde 9 individuos están por encima del promedio y 15 se encuentran por debajo; esto nos indica que más de la mitad de la población está produciendo leche de bajo contenido en grasa y pueden presentarse problemas en los rendimientos y venta de la leche. La varianza registra 0.86, no están muy alejados de la media lo que permite evidenciar homogeneidad.
2.4 Indague sobre los siguientes conceptos, sea breve y conciso en su respuesta:
Estadística descriptiva: organiza la información numérica para una mejor interpretación. Medidas de tenencia central: son medidas estadísticas que pretenden resumir en un solo valor a un conjunto de valores.
Hipótesis: suposición a partir de unos datos para iniciar una investigación o una argumentación. Prueba de hipótesis: es una regla que especifica si se puede aceptar o rechazar una afirmación acerca de una población dependiendo de la evidencia proporcionada por una muestra de datos. Error tipo I: rechazar la hipótesis nula cuando es verdadera Error tipo II: cuando la hipótesis nula es falsa y erróneamente no es rechazada.