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FACULTAD DE CIENCIAS NATURALES

Código-Materia: Requisito Programa – Semestre: Período académico: Intensidad semanal: Créditos: Profesores:

21120 Microbiología Médica 21121 Laboratorio de Microbiología Médica Medicina – 3er semestre Enero - Mayo 2015 Seis (6) horas semanales teóricas y tres (3) horas semanales de práctica (dos (2) grupos de teoría y dos (2) grupos de laboratorio) Cuatro (4) Nora Guarín Díaz (Coordinadora de Micología) Claudia Rocío Castañeda (Coordinadora de Bacteriología) María Yaneth Arango (Coordinadora de Virología) Jorge Iván Zapata Valencia (Coordinador de Parasitología y Coordinador General del Curso)

DESCRIPCIÓN GENERAL DEL CURSO El curso de Microbiología Médica (Código 21120) está diseñado para que los estudiantes de medicina conozcan e identifiquen los más relevantes microorganismos relacionados con patologías humanas, clasificados en general en cuatro grupos principales que son Bacterias, Hongos, Virus y Parásitos. En esta asignatura se ha diseñado un módulo para cada uno de los grupos de microorganismos y para uno se han seleccionado las principales especies que afectan al hombre y se estudiarán su comportamiento biológico y su relación con el hombre como agentes causales de enfermedad, tocando aspectos relevantes a la biología, la patofisiología, la presentación clínica, la epidemiología y la respuesta inmune en su relación con el hospedero humano. Los estudiantes harán lecturas previas de cada tema en los textos recomendados para cada uno de los módulos y estos se discutirán en clase. Además se realizarán prácticas supervisadas complementarias en las cuales reconocerán los microorganismos, estructuras de los mismos y métodos diagnósticos. Así mismo, se iniciará a los estudiantes en el conocimiento de los derechos de los pacientes aprovechando el contexto de las enfermedades infecciosas para fomentar en ellos una conducta ética. OBJETIVOS Al finalizar el curso de Microbiología, los estudiantes estarán en capacidad de OBJETIVO GENERAL: Identificar y clasificar los principales microorganismos que afectan la salud humana, describir su comportamiento biológico, la manera como causan enfermedad y los principales métodos para 1

su diagnóstico. Habrán podido adquirir una visión ética y humana basada en el respeto a los pacientes en el entorno de las enfermedades infecciosas, evaluable a través del conocimiento de los derechos de los pacientes. TERMINALES: OBJETIVOS ESPECÍFICOS: a. Identificar los diferentes microorganismos ubicándolos dentro de la escala evolutiva explicando los fundamentos para su ubicación en la misma y para su clasificación taxonómica. b. Describir, identificar y clasificar los principales grupos de bacterias, virus, parásitos y hongos que producen patología en humanos. c. Identificar y describir los aspectos atinentes a la biología de los microorganismos, su interacción con el hospedero humano y con sus mecanismos de defensa y de resistencia, que derivan en enfermedad y sus manifestaciones clínicas. d. Conocer y saber utilizar las herramientas y técnicas disponibles para la detección e identificación de los microorganismos y las ayudas diagnósticas para enfermedades infecciosas. e. Conocer y haber apropiado los derechos de los pacientes que aplicarán durante todo su ejercicio profesional. DE FORMACIÓN ACADÉMICA: a. Tener la disposición para aprender y aplicar la información adquirida. b. Demostrar progresiva adquisición de conocimientos mediante la participación en actividades académicas. c. Demostrar una efectiva comunicación de la información aprendida. d. Demostrar respeto por los pacientes independientemente de su credo, condición social, identidad sexual, etc. e. Demostrar respeto por sus compañeros y profesores. DE FORMACIÓN EN VALORES Y CAPACIDADES VALORES Al terminar el curso cada estudiante habrá tenido la oportunidad de adquirir una noción ética de la enfermedad infecciosa en el entorno social, teniendo en cuenta los derechos de los pacientes y, además, desarrollar y apropiar los siguientes valores que contribuyen a su formación como persona y profesional de la medicina: Responsabilidad Compromiso Autoestima Perseverancia Autonomía Curiosidad intelectual Integridad Honestidad Justicia Tolerancia 2

Solidaridad Respeto por la Naturaleza CAPACIDADES: Al terminar el curso cada estudiante habrá tenido la oportunidad de mejorar las siguientes capacidades que contribuyen a su formación como persona y profesional de la medicina: Análisis Síntesis Conceptualización Manejo de información Pensamiento crítico TEMÁS DE LOS MÓDULOS MÓDULO DE PARASITOLOGÍA Objetivos Se espera que el estudiante al finalizar el módulo esté en capacidad de: a. Describir las principales clases de parásitos, sus estructuras más importantes y las diferencias entre ellos. b. Diferenciar las enfermedades parasitarias más comunes en nuestro medio, su epidemiología y prevención. c. Identificar los principales parásitos emergentes de importancia en humanos. d. Explicar los principales mecanismos que protegen de la infección e infestación por parásitos patógenos al humano. e. Identificar los diferentes métodos usados para diagnóstico y detección de parásitos. f. Identificar potenciales áreas de investigación g. Describir los diferentes grupos de parásitos en la escala evolutiva e identificará los principales patógenos para los humanos. h. Explicar los términos usados en parasitología. i. Identificar las estructuras características de los parásitos de interés en salud humana. j. Relacionar los parásitos con las características clínicas del paciente k. Identificar los estadios diagnósticos de los parásitos. l. Reconocer los cuadros clínicos generados por los principales parásitos, sus características clínicas, mecanismos de defensa del humano y epidemiología de las enfermedades parasitarias. Temario general: a. b. c. d. e. f. g. h. i. j.

Generalidades y conceptos básicos de parasitología Importancia de los parásitos como agentes de enfermedad en humanos Términos técnicos en parasitología Generalidades de los protozoarios Protozoosis intestinales y tisulares Generalidades de Platelmintos: digéneos y céstodos Platelmintos intestinales y tisulares Generalidades de Nematodos Nematodos intestinales y tisulares Artrópodos como vectores y causantes de enfermedad

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MODULO DE VIROLOGÍA Objetivos Se espera que el estudiante al finalizar el módulo esté en capacidad de: a. Describir los diferentes grupos de virus patógenos para los humanos. b. Identificar las estructuras básicas que conforman los virus. c. Relacionar los virus con las características clínicas del paciente, reconocerá los mecanismos de patogénesis, los cuadros clínicos, mecanismos de defensa del humano y epidemiología de las enfermedades virales. d. Analizar y discutir casos clínicos. Interpretar los exámenes de laboratorio que son ayuda diagnóstica para las enfermedades producidas por virus. Temario general: a. Generalidades, clasificación, estructura, mecanismos de replicación. b. Patógenesis viral c. Métodos diagnósticos en virología d. Flaviviridae (dengue y fiebre amarilla) e. Retroviridae: HTLV-1, HTLV-2 , VIH) f. Herpersviridae (HSV1-2, CMV, EBV, Varicela) g. Orthomixoviridae/Influenza y virus respiratorios h. Paramixoviridae como agente de eruptivas de la niñez i. Rabdoviridae y otros virus zoonóticos j. Hepatitis A y B k. Hepatitis C y bioseguridad. Otras hepatitis l. Papilomaviridae y otros virus oncogénicos. m. Enterovirus y enfermedad diarreica aguda n. Proteínas autoreplicantes y bioterrorismo MÓDULO DE BACTERIOLOGÍA Objetivos Se espera que el estudiante al finalizar el módulo esté en capacidad de: a. Describir las principales clases de bacterias y sus estructuras más importantes. b. Describir las principales características y función de las estructuras que poseen las bacterias. c. Identificar los elementos clave para el aislamiento y crecimiento bacteriano. d. Identificar los agentes y métodos físicos y químicos para control microbiano. e. Explicar los principales mecanismos que protegen de la invasión y proliferación de bacterias patógenas. f. Identificar los diferentes métodos usados para diagnóstico y detección de bacterias. g. Diferenciar las enfermedades bacterianas más comunes en nuestro medio, su epidemiología y prevención. h. Identificar potenciales áreas de investigación Temario general: a. Generalidades de las bacterias 1. Estructura bacteriana 2. Metabolismo y crecimiento 4

3. Genética bacteriana 4. Biota normal 5. Métodos físicos y químicos para esterilización y desinfección. 6. Actividades bactericida, bacteriostática y bacteriolítica. 7. Medios de cultivo para bacterias 8. Coloraciones para bacterias b. Estructura, patogenia, enfermedades clínicas, epidemiología, diagnóstico, tratamiento, prevención y control. c. Grupos de bacterias: 1. Familia Enterobacteriaceae: Escherichia coli Klebsiella spp. Enterobacter spp. Yersinia spp. Salmonella spp. Shigella spp. 2. Familias Vibrionaceae y Aeromonadaceae Vibrio Aeromonas 3. Familias Pseudomonadaceae y Moraxellaceae Pseudomonas Acinetobacter 4. Infecciones Nosocomiales Bordetella pertusis Francisela spp. Brucella spp. Legionella pneumophyla 5. Familia Spirochaetaceae Treponema pallidum Borrelia Leptospira 6. Familias Campylobacteraceae y Helicobacteraceae Campylobacter Helicobacter 7. Familia Neisseriaceae Neisseria gonorrhoeae . Neisseria meningitidis 8. Familia Pasteurellaceae Haemophilus inluenzae Haemophilus ducreyi 9. Micobacterias: Mycobacterium tuberculosis. M. leprae Micobacterias no tuberculosas. 10. Bacilos Gram Positivos 1ª parte: Microorganismos Filamentosos Actinomicetos. Actinomyces spp., Streptomyces spp., Nocardia spp. 11. Bacilos Gram positivos 2ª parte: Corynebacterium Listeria monocytogenes Bacillus anthracis 5

12. Bacterias anaerobias: Bacteroides Clostridium: bacilos Gram-positivos esporulados. 13. Cocos Gram positivos 1ª parte: Staphylococcus: características generales. Staphylococcus aureus 14. Cocos Gram positivos 2ª parte: Streptococcus: S. pyogenes y S. pneumoniae Enterococcus 15. Bacterias intracelulares obligadas: Chlamydia Rickettsia Mycoplasma Ureaplasma El alumno estudiará los capítulos correspondientes a los temas anteriores y la literatura adicional que le indique el profesor, investigará y preparará los temas y resolverá talleres. Diferenciará los principales microorganismos componentes de la biota normal y desarrollará las guías de trabajo en las prácticas. Podrá identificar las características de una buena muestra para el diagnóstico de enfermedad por bacterias. Describirá los principales factores de virulencia y patogenicidad de las bacterias y su relación con el desarrollo de la enfermedad. Reconocerá los principales mecanismos de resistencia y fundamentos de la interpretación de los antibiogramas. Analizará y discutirá casos clínicos causados por las diferentes bacterias patógenas. Interpretará los exámenes de laboratorio que son ayuda diagnóstica para las enfermedades bacterianas. Desarrollará la capacidad para identificar problemas de salud de relevancia en su comunidad. MODULO DE MICOLOGÍA Objetivos Se espera que el estudiante al finalizar el módulo esté en capacidad de: a. Describir las principales clases de hongos que afectan a los humanos y sus estructuras más importantes. b. Identificar los elementos clave para el aislamiento y crecimiento de los hongos. c. Explicar los principales mecanismos que protegen de la infección por hongos. d. Identificar los diferentes métodos usados para diagnóstico y detección de hongos. e. Diferenciar las enfermedades fúngicas más comunes en nuestro medio, sus factores predisponentes, manifestaciones clínicas, epidemiología y prevención. f. Identificar potenciales áreas de investigación. g. Conocer los derechos de los pacientes. Temario general: 1. Generalidades, taxonomía, estructuras y reproducción de los hongos 2. Identificación microscópica de los hongos y aplicación de los diferentes métodos de diagnóstico 3. Micosis superficiales: 6

Pitiriasis Tiñas 4. Micosis subcutáneas: Esporotricosis Zygomicosis Feohifomicosis Lacaziosis 5. Micosis sistémicas: Blastomicosis Coccidioidomicosis Histoplasmosis Paracoccidioidomicosis 6. Micosis oportunistas: Candidiasis Criptococcosis Pneumocistosis Trychosporonosis Malazessiosis Aspergilosis Zygomycosis El alumno estudiará y memorizará los términos y conceptos básicos de la micología. Explicará los diferentes métodos diagnósticos de hongos y su aplicabilidad y utilidad. Reconocerá las estructuras microscópicas de los hongos. El estudiante estará en capacidad de identificar los principales hongos que causan enfermedad, su relación con los humanos, la respuesta inmune que generan, las características clínicas de las lesiones y la epidemiología. METODOLOGÍA La metodología estará basada en el método de aprendizaje activo, en donde el profesor introducirá el tema que será estudiado y desarrollado por los estudiantes aplicando las herramientas, métodos y actividades que sugiera el profesor para la discusión y comprensión del tema, con una síntesis que se hará al final de la clase a manera de conclusión. Las prácticas complementarán especialmente el conocimiento sobre la morfología, diagnóstico y mecanismos de resistencia de los microorganismos y contribuirán a la correlación clínica. Estas prácticas se realizarán con base en una guía elaborada por el profesor, la cual debe ser conocida y estudiada por cada estudiante antes de la práctica y desarrollada durante ella. ACTIVIDADES DEL ESTUDIANTE Antes de la clase: a. Verificación de los objetivos descritos para cada tema a tratar en la clase. b. Estudio y aprendizaje del material asignado con anterioridad. c. Resolución de las tareas asignadas para el aprendizaje individual o en grupo. Durante la clase: El estudiante debe tener una activa participación en la discusión del tema y participará en todas las actividades que asigne el profesor para facilitar su aprendizaje o para evaluación. 7

Después de la clase: a. El estudiante debe repasar lo aprendido antes y durante la clase para facilitar la consolidación del conocimiento y relacionarlo con lo aprendido en otros cursos. b. El estudiante debe revisar de nuevo los objetivos finales de aprendizaje y verificar que puede explicar cada uno de ellos. c. El estudiante debe revisar los conceptos aprendidos antes y durante la clase, si tiene dificultad en explicar algunos de los objetivos finales de aprendizaje. d. El estudiante resolverá los talleres que sean asignados por el profesor. EVALUACIÓN La evaluación está distribuída en los siguientes aspectos:

Cada Módulo

Evaluación Total Primer parcial Segundo parcial Prácticas de laboratorio Otras Actividades: Comprobación de lectura, Talleres, Estudio de Casos, Ejercicios en clase

Valor porcentual 100% 30% 30% 20% 20%

La Nota Final (NF) se calculará sumando las notas individuales de cada módulo: NF = (Bacteriología x 0.25) + (Parasitología x 0.25) + (Virología x 0.25) + (Micología x 0.25) Nota: No se aceptan ni programan actividades adicionales para mejorar las calificaciones obtenidas por lo tanto se recomienda asumir el curso con responsabilidad y dedicación y participar activamente para hacer todo lo posible por obtener buenos resultados en todos los módulos. BIBLIOGRAFÍA El texto guía del curso es el libro Medical Microbiology, 6th Edition. Autores: Patrick R. Murray, Ken S. Rosenthal, Michael A. Pfaller. Editorial: Elservier-Mosby. Año: 2009. Los profesores participantes en cada módulo recomendarán otros textos, artículos y páginas web que considere relevantes para sus áreas o temas. Reglas de juego: 1. Las clases teóricas y las prácticas de laboratorio comienzan a la hora fijada. Se recomienda puntualidad en la asistencia. 2. Se recomienda limitar la entrada y salida del salón de clase y de los laboratorios para mantener orden y concentración de los estudiantes en las explicaciones que se imparten.

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3. No está permitido el consumo de alimentos a bebidas ni en las clases ni en las prácticas de laboratorio. 4. Al inicio de cada laboratorio, los estudiantes deben dejar sus pertenencias en los lockers, dejando únicamente a disposición el material de trabajo. 5. Para el ingreso al laboratorio los estudiantes deben seguir las instrucciones dadas por los docentes, entre las que se incluye el uso del vestuario requerido (overol, gorro, tapabocas, zapatos cerrados o polainas) y otras recomendaciones de bioseguridad (no usar shorts, no usar maquillaje). 6. Las opiniones emitidas en las clases y laboratorios, pueden ser discutidas y cuestionadas pero NO pueden constituirse en objeto de burla. 7. La asistencia a las prácticas de laboratorio es obligatoria y se verificará con llamado a lista, la no asistencia al 20% o más de las sesiones de laboratorio determinará la NO APROBACION de éste. 8. El estudiante debe asistir a las clases y laboratorios en el horario y grupo en el cual se matriculó. No se admite la asistencia en un horario o grupo diferente al matriculado. 9. Las prácticas de laboratorio y los informes correspondientes a las mismas que se realicen cuando el profesor lo indique, se deben elaborar por los grupos definidos. Para ello, al inicio de cada práctica se informará al profesor como queda conformado su equipo de trabajo. Cualquier modificación de los integrantes del equipo debe ser consultada previamente con el profesor y autorizada por el mismo. 10.Para cada una de las clases teóricas y las prácticas de laboratorio, el estudiante revisará la bibliografía recomendada para cada tema, las guías y se preparará con anticipación. 11.Al inicio de la práctica se aclararán aspectos relacionados al cumplimiento de los objetivos y se resolverán dudas que existan sobre aspectos teóricos y conceptuales. 12.Se realizarán comprobaciones de lectura escritas al inicio de la jornada de teoría o laboratorio, según criterio de cada docente. 13.Todas las comprobaciones de lectura que se realizan son individuales, a menos que el profesor indique, explícitamente, lo contrario. 14.Los informes de laboratorio (solución a las preguntas presentes en las guías u otras actividades programadas), talleres y casos clínicos se entregarán por cada uno de los grupos de trabajo, en la fecha acordada en clase. Este se debe realizar según los parámetros dados por el profesor para la elaboración del mismo. 15.Los estudiantes deben hacer un uso correcto de los microscopios y estereoscopios, si no sabe su funcionamiento debe consultar con los instructores antes de usarlos. 16.Los estudiantes deben velar por el cuidado de las láminas de las colecciones (lámina que se dañe se debe reportar al docente o monitor). 17.El laboratorio debe ser conservado en orden y deben evitarse los actos de indisciplina que pongan en riesgo a los compañeros y los implementos de laboratorio.

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18. Se consideran fraude, además de lo mencionado en el “Libro de Derechos, Deberes y Normas de los Estudiantes de Pregrado de la Universidad Icesi”:  el compartir entre grupos el archivo digital o físico de los trabajos (informes de laboratorio) elaborados individualmente o por cada equipo o grupo, esto incluye los trabajos académicos elaborados en semestres anteriores.  tener cualquier tipo de dispositivo de comunicaciones encendido durante un examen. También se considera fraude tener en ejecución cualquier tipo de programa de comunicación – chat, correo electrónico, o cualquier otro de este tipo – durante un examen. Por tanto el trabajo académico o la prueba en la cual se encuentre alguno de los hechos descritos en este numeral tendrá una calificación de cero (0.0). 19.El fraude o intento del mismo será tratado de acuerdo al “Libro de Derechos, Deberes y Normas de los Estudiantes de Pregrado de la Universidad Icesi”, sin entrar a discutir qué lo motivó. 20.Se espera una actitud dinámica y respetuosa en el desarrollo de las clases y prácticas de laboratorio, por lo tanto:  Las charlas y las visitas se hacen en espacios diferentes al aula de clase.  Los celulares durante las clases y las prácticas deben estar apagados preferiblemente ó en modo silencioso y guardados de manera que no haya la tentación de usarlos. De no cumplir con estos comportamientos, la clase o la práctica se interrumpirán hasta que se haya recuperado la situación normal dentro del aula o laboratorio. 21.El trato en todo momento debe ser respetuoso: las muestras de excesiva confianza, las expresiones vulgares, las demostraciones de afecto, o de cualquier otro sentimiento, tienen cabida en otros espacios, no durante las clases o prácticas.

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