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El fitoplancton forma la base de la cadena alimenticia en los estanques de acuicultura, pero la abundancia natural del fitoplancton no es suficiente para proporcionar niveles deseados en la producción de camarones y peces. Los fertilizantes incrementan la fertilidad natural de los estanques de cultivo y permiten mayores rendimientos. Muchos productores, sin embargo, han escogido hacer una acuicultura basada en alimentación para incrementar la producción más allá de lo posible con fertilizantes. La productividad natural sigue siendo importante aún en estanques con alimentación, especialmente al poco tiempo después de la siembra, ya que con las jóvenes postlarvas y alevines no se puede utilizar alimento tan eficientemente como los animales más viejos. Algunos acuicultores, productores camarón en particular, evalúan la abundancia y composición taxonómica de las comunidades de fitoplancton en agua de estanques. También se aplican diversos tratamientos en los intentos de controlar la abundancia y composición de las comunidades de fitoplancton. Los propágulos de algas están en todas partes, si llenamos con agua un estanque nuevo, muchas especies de fitoplancton encontraran la manera de ingresar. El crecimiento del fitoplancton está regulado por la temperatura del agua, la radiación solar, el pH, la turbidez y la concentración de nutrientes. Los estanques de agua ácida normalmente se tratan con materiales calcáreos para elevarel pH. La turbidez causada por partículas del suelo en suspensión, usualmente se precipita en el agua retenida de los estanques y los nutrientes son suministrados por los fertilizantes y alimentos artificiales. Los estanques de acuicultura suelen tener las condiciones ideales para el crecimiento de fitoplancton.  
 

  
La densidad de las floraciones de fitoplanctones fuertemente de la disponibilidad de nutrientes, especialmente nitrógeno y fósforo. Los estanques de acuicultura intensiva con grandes insumos de alimentación por lo general tienen abundancia del fitoplancton, y también florece llegando a bastante altas densidades en estanquessemi-intensivo. La composición de las especies de floraciones de fitoplancton es muy variable y puede cambiar rápidamente con el tiempo. Muchos han observado que estanques acuícolas adyacentes recibiendo similar manejo de insumos, rara vez tienen aguas de igual claridad o color. Las diferencias en la apariencia de las aguas de los estanques resultan de las diferencias en la composición y densidad de las floraciones del fitoplancton. Un estanque puede tener un florecimiento de fitoplancton que consiste principalmente de diversas especies de algas verdes, pero dentro de unas semanas, la comunidad de fitoplancton podría estar compuesta casi en su totalidad de una sola especie de alga azul-verdosa. Alternativamente, el florecimiento de algas verdes en un estanque puede persistir, pero las especies en

la floración pueden cambiar durante un periodo de pocas semanas. La abundancia total de fitoplancton también aumenta y disminuye, aun cuando los aportes de nutrientes son relativamente constantes. A 
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En estanques de acuicultura, algunas especies de fitoplancton son más deseadas que otras. Las Algas azul-verdosas llamadas cianobacterias por algunos, son particularmente problemáticas. Las densas floraciones de algas azul-verdosas, como aquellas de otras algas, causan amplias fluctuaciones diarias en la concentración de oxígeno disuelto. La aireación mecánica ha contribuido como una forma de evitar excesivas concentraciones bajas de oxígeno disuelto durante la noche en estanques intensivos de acuicultura. Las algas azul-verdosas a menudo flotan en la superficie y forman espumas en clima calmado. Las espumas absorben calor y eleva la temperatura superficial del agua. Ellas a menudo se aglomeran en las esquinas de los estanques, donde mueren y esto resulta en un deterioro localizado de la calidad de agua y suelo. También, los florecimientos de algas azul-verdosas tienden a morir repentinamente. Densos florecimientos de fitoplancton que consisten de una sola especie de alga azul-verdosa y un clima calmado, cálido, con intensa radiación solar, son las condiciones que favorecen la mortalidad del fitoplancton. Mortalidades masivas pueden llevar a una disminución de oxígeno incluso con la operación de los aireadores mecánicos. Además de causar problemas de calidad de agua, algunas especies de Oscillatoria, Anabaena, Microcystis, lyngbya, Aphanizomenom y algunos otros géneros de algas azul-verdosas son notorias por producir compuestos malolientes que, cuando son absorbidos por peces y camarones, causan mal sabor en su carne. Una vez que los compuestos de mal sabor desaparecen del agua, sufren una depuración natural de la carne de la especie de cultivo. Los estanques pueden ser tratados con sulfato de cobre para eliminar a las algas azul-verdosas, a una proporción igual al 1% de la alcalinidad total. Luego de eliminar el foco de los compuestos malolientes, los animales de cultivo frecuentemente, pero no siempre, recuperan un sabor normal dentro de una o dos semanas. En estanques costeros, el recambio de agua puede ser usado para retirar las algas productoras del mal sabor de los estanques. Los factores que favorecen a las algas azul-verdosas en los estanques son, la alta concentración de nutrientes y un pH arriba de 8.3. El alto pH favorece a estas algas porque son mucho más competitivas que otras algas por la baja concentración de carbón inorgánico disponible a pH alto. Los estanques acuícolas son ideales para las algas azul-verdosas, porque abundan los nutrientes con los cuales las algas se multiplican rápidamente. Esto reduce las concentraciones de dióxido de carbono, se eleva el pH y finalmente favorece la dominancia de las algas. La investigación también ha demostrado que las algas azul-verdosas pueden liberar sustancias alguicidas al agua que son tóxicas a otros tipos de alga. En los Estados Unidos, 75 -80 % de los estanques del bagre de canal tienen

comunidades de fitoplancton dominadas por algas azul-verdosas a fines del verano e inicios del otoño. Las azul-verdosas ocurren en aguas salobres, pero su abundancia tiende a ser más alta cuando las salinidades están debajo de 10 Å. Algunas especies de algas azul-verdosas producen toxinas que pueden matar a peces y camarones. Las algas tóxicas más famosas son las especies del genero Prymnesium y Chrysochromulina. Estas algas son principalmente marinas, pero algunas especies de Prymnesium pueden crecer muy bien en aguas de tierra adentro con salinidades superiores a 2 Å (partes por mil). Mortalidades de peces a menudo son causadas por florecimientos del alga dorada P. parvum. Recientemente en Alabama, Estados Unidos, esta especie causó mortalidad y pobre crecimiento del camarón en estanques de tierra adentro con salinidades de 2-5 Å. Otras algas tóxicas incluyen algunas especies de dinoflagelados (la marea roja es causada por el dinoflagelado Ptychodiscusbrevis), unas pocas diatomeas y cloromonasmarinas. En estanques de agua dulce, el sulfato de cobre se usa para eliminar algas toxicas. Algunos productorestratan el agua con 2-4 mg. de permanganato de potasio/lt para oxidar toxinas de algas que permanecen en el agua. En estanques costeros, algunas veces es posible erradicar las algas tóxicas de los estanques con recambio de agua. — 

   
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Dejando a un lado las algas tóxicas y azul-verdosas, la mayoría de otras algas planctónicas no son particularmente problemáticas en la acuicultura de estanques. Las algas verdes son consideradas más deseables en estanques de agua dulce. Muchos productores de estanques de agua marina y salobre para el cultivo de camarón, prefieren florecimientos de diatomeas, debido a que estas algas son consideradas un buen alimento natural para el camarón. No hay métodos confiables para mantener los florecimientos de algas verdes en los estanques de agua dulce. Aunque los estanques pueden tener algas verdes al inicio del cultivo, la dominancia del fitoplancton después cambia a menudo a la las algas azulverdosas. Investigación llevada a cabo en agua confinada dentro de grandes recintos plásticos cerrados en un lago eutrófico, mostró que las algas azul-verdosas fueron reemplazadas por algas verdes cuando el dióxido de carbono fue introducido en los recintos. Como resultado, algunas camaroneras añaden estiércol o melazas a los estanques para estimular la producción microbiana de dióxido de carbono para bajar el pH y disminuir las algas azul-verdosas. El beneficio de este procedimiento no ha sido probado a través de un estudio cuidadoso. Los camaroneros han sido exitosos en estimular la producción de diatomeas en estanques de agua marina y salobre, fertilizando con una amplia proporción de nitrogeno:fosforo de 10 a 20 veces más nitrógeno que fósforo. Muchos productores de camarón creen que una alta abundancia de diatomeas es favorecida por la fertilización con nitrato y silicato. Un fertilizante comercial de Chile específicamente formulado para incrementar la abundancia de diatomeas en estanques de camarón contiene tanto nitrato de sodio como silicato. Conclusiones

de investigación también sugieren que la adición de hierro al agua de mar debería estimular a las diatomeas, pero ningún estudio ha verificado la eficiencia de este tratamiento en estanques de camarón. En intentos para reducir la abundancia de fitoplancton, compuestos de calcio, hierro y aluminio han sido aplicados a estanques para precipitar el fósforo del agua. La lógica detrás de este método es que la remoción de fósforo baja la tasa de fotosíntesis, incrementa la disponibilidad de dióxido de carbono y baja el pH, una secuencia de eventos desfavorable para el crecimiento de algas azulverdosas. En investigaciones se ha visto algún éxito de estos tratamientos, pero son rara vez usados por productores comerciales. c  

 

Muchos cultivadores de camarón rutinariamente cuentan la abundancia de los diferentes géneros de algas en el agua de los estanques. Además de fertilizar, para incrementar diatomeas o tratar algas productoras del mal sabor, con sulfato de cobre, poco se puede hacer para controlar la composición de comunidades de algas. Es dudoso que valga la pena el tremendo esfuerzo para el conteo de algas. Sin embargo, alguna evaluación de las comunidades de algas es necesaria para determinar si, especies potencialmente tóxicas o especies con capacidad para producir malos olores, están presentes.