DIVERSIDAD MICROBIANA EN EL AMBIENTE Clasificados en: Eucariontes Procariontes Afectan la salud y bienestar humano
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DIVERSIDAD MICROBIANA EN EL AMBIENTE Clasificados en: Eucariontes Procariontes Afectan la salud y bienestar humano, son esenciales para mantener “la vida tal como se conoce”.
TAMAÑO
COMPLEJIDAD
VIRUS
ACELULAR
BACTERIA
PROCARIONTE
FUNGI
ALGAE
EUCARIONTE
PROTOZO O
EVOLUCIÓN MICROBIANA
Los fosiles muestran procariontes de 3500 millones de años.
Mediante métodos moleculares es posible determinar relaciones evolutivas
Secuenciación de ácidos nucleicos Comparación de secuencias (Bioinformaticas)
CRONÓMETROS EVOLUTIVOS
Las comparaciones de secuencias del RNA ribosómico son útiles para determinar las relaciones evolutivas entre microorganismos.
CRONÓMETROS EVOLUTIVOS
Molécula distribuida.
universalmente
Homología funcional. Su secuencia cambia con una velocidad proporcional a la distancia filogenética.
SECUENCIACIÓN DEL RNA RIBOSÓMICO Organismo
Aislar ADN
PCR
Secuenciación
ÁRBOL FILOGENÉTICO DEL RNA RIBOSÓMICO
La distancia evolutiva se calcula mediante el recuento de todas las posiciones en las que exista una diferencia
ÁRBOL FILOGENÉTICO DEL RNA RIBOSÓMICO
La distancia evolutiva se calcula mediante el recuento de todas las posiciones en las que exista una diferencia
FILOGENIA DERIVADA DEL ARNR
Inicialmente los biólogos agruparon el mundo de los seres vivos en 5 reinos en base a las características estructurales:
FILOGENIA DERIVADA DEL ARNR
Inicialmente los biólogos agruparon el mundo de los seres vivos en 5 reinos en base a las características estructurales:
FILOGENIA DERIVADA DEL ARNR
La filogenia molecular manifiesta que la vida celular en la tierra ha evolucionado siguiendo sólo tres grandes linajes
FILOGENIA DERIVADA DEL ARNR Evoluciono para dar la actual célula eucariótica
Permanecieron procarióticos
TAXONOMÍA VS FILOGENÍA Identificación
TAXONOMIA: Ciencia de la clasificación Utiliza
Nomenclatura
Análisis fenotípicos: Aspecto, metabolismo energético, enzimas, etc. FILOGENÍA Estudia la historia evolutiva de los microorganismos
TAXONOMÍA BACTERIANA
La taxonomía bacteriana convencional concede gran importancia a los análisis descriptivos de las propiedades fenotípicas de los microorganismos. Categoría principal
Componentes
I. Morfología
Forma, tamaño y tinción de Gram.
II. Movilidad
Móvil por flagelos, móvil por deslizamiento, no móvil.
III: Nutrición y fisiología
Mecanismos de conservación de energía (fototrofo, quimiolitotrofo, quimiorganotrofo); relación con el oxigeno y la temperatura; pH y requerimiento/tolerancia a sal; capacidad para usar varias fuentes de carbono, nitrógeno y azufre.
IV. Otros factores
Pigmentos, inclusiones celulares o capas superficiales, patogenicidad y resistencia a antibióticos
TAXONOMÍA BACTERIANA
Aislamiento de una bacteria del intestino de un animal homeotermo
Pruebas bioquímicas
Obtención del cultivo puro
Tinción de Gram
Gram negativo Forma de bacilo Facultativo Fermenta lactosa Producción ácidos y gas
TAXONOMÍA MOLECULAR
Hibridación ADN:ADN
Si dos organismos comparten muchas secuencias nucleotidicas, es probable que contengan muchos genes similares.
Sus ADN´s podrían hibridarse en proporción a las semejanzas en sus secuencias génicas
TAXONOMÍA MOLECULAR
TAXONOMÍA MOLECULAR
TAXONOMÍA MOLECULAR
Hibridación 70% o superior
Misma especie
Hibridación 20-30%
Mismo genero
Hibridación menor al 10%
No hay relación
ESPECIE
En animales y plantas, una especie se considera como una población de individuos que pueden entrecruzarse en condiciones naturales produciendo una descendencia fértil y que esta aislada reproductivamente de otras poblaciones
ESPECIE
Las especies en procariontes se definen mediante métodos como la secuenciación del ARNr y la hibridación genómica Especie 1
Especie 2
Secuencia del ARNr 16s < 97%
Nueva especie
ESPECIE
Relación entre la similitud de secuencia del ARNr y la hibridación del ADN
GENERO Los grupos de especies se agrupan en géneros 93-95% de identidad en las secuencias del ARN 16s
Géneros Familias Ordenes Clases Dominios
GENERO
FILOGENIA BACTERIA
Se conocen 17 linajes principales (phyla) de Bacteria que derivan de cultivos de laboratorio.
LINEA EUCARIOTA
Las células eucariotas constituyen su propia linea evolutiva
Giardia
Trichomonas
No poseen mitocondria Evidencia de genes bacterianos en su genoma.
LÍNEA EUCARIOTA Carecen de organulos, genoma pequeño, datos moleculares de evolución rápida y cercano a los hongos
PROTOZOOS
Son Eukarya unicelulares que carecen de pared celular y generalmente móviles. Muchos protozoos son patógenos de humanos y animales Se distinguen de:
Por:
PROTOZOOS
PROCARIONTES
PROTOZOOS
ALGAS
PROTOZOOS
HONGOS Y LEVADURAS
TAMAÑO
CLOROFILA
MOVILIDAD Y DE PARED
PROTOZOOS
La mayoría se alimentan por fagocitosis.
Algunos pueden “tragar” bacterias o eucariotas pequeñas mediante el citostoma.
Clasificación en base a su movilidad
PROTOZOOS: MASTIGOPHORA Móviles por flagelos Vida libre y parásitos de animales
Trypanosoma: Causante de la enfermedad del sueño 20 micras de longitud El flagelo y membrana le ayudan a moverse a traves sustancias viscosas
PROTOZOOS: SARCODINA Movimientos amiboides Se conoce un buen numero de amebas parasitas de humanos y otros vertebrados (cavidad bucal y TGI)
Entamoeba histolytica: Infección asintomática. Disentería amebiana (ulceraciones en tracto intestinal y diarrea). Transmision de persona a persona mediante cistos en agua y alimentos.
PROTOZOOS: SARCODINA Entamoeba histolytica: Infección asintomática. Disentería amebiana (ulceraciones en tracto intestinal y diarrea). Transmision de persona a persona mediante cistos en agua y alimentos.
PROTOZOOS: CILIOPHORA Al menos en alguna fase de su vida poseen cilios Dos clases de núcleos:
Micro núcleo: herencia y reproducción sexual Macro núcleo: crecimiento y otras funciones celulares
PROTOZOOS: APICOMPLEJOS (ESPOROZOOS) Parásitos obligados. Se caracterizan por ser inmóviles en estado adulto. Forman esporozoitos implicados en la transmisión a un nuevo hospedador.
Plasmodium falciparum: Causante de la malaria. Tiene dos huéspedes en su ciclo vital, el mosquito (vector) y el hombre.
PROTOZOOS: APICOMPLEJOS (ESPOROZOOS)
HONGOS Eucariontes heterotróficos Poseen una pared gruesa hecha de polisacáridos con quitina. Estados motiles ausentes, nunca forman flagelos. Crecimiento ramificado Hifas septadas y cenocitico
HONGOS
Estructuras somáticas: Unidad funcional
Hifa
Micelio
Hifas verdaderas: propias de los hongos filamentosos Pseudohifas: propias de levaduras que no se desprenden durante la gemación
HONGOS: CLASIFICACIÓN DE MICELIO Macrosifonado Diámetro > 1μm
Micelio Microsifonado Diámetro < 1μm
Hialino Micelio
Pigmentado
HONGOS
HONGOS
A partir del micelio, otras hifas buscan la superficie donde forma esporas o conidios (asexuales)
Ascosporas Esporas (sexuales)
Basidiosporas
Zigosporas
Ascosporas Se forman dentro de un saco (asca)
Basidiosporas Se forman en los extremos de una estructura en forma de “porra”
zigosporas Poseen una pared muy gruesa
HONGOS UNICELULARES (LEVADURAS) La mayoría pertenece a los ascomicetos. Ovales, esféricas o casi cilindricas. División por gemación Bajo ciertas condiciones pueden filamentar
ALGAS Grupo diverso de eucariontes con clorofila y llevan acabo la fotosíntesis oxigenica. La mayoría son microscópicas Algunas macroscópicas (laminarias 30 metros)
ALGAS
ALGAS
Muchas son motiles, usualmente por flagelos.
Pared celular formada por pectina, celulosa o xilano. En algunos casos calcificada por CaCO3.
Reproducción sexual o asexual.
ALGAS Beneficios o problemas para el ser humano. Dunaliella, alga halotolerante. Debido a su enorme contenido de β-caroteno, colorean el suelo salino de un rojo intenso. Para equilibrar el valor osmotico externo concentran glicerina en cantidad considerable
Obtención industrial de glicerina y β-caroteno
ALGAS COMESTIBLES En muchos países existen granjas de algas. Requieren de grandes superficies donde las algas reciban suficiente luz solar
Aun así un factor indispensable es el agua En condiciones de producción favorable 1 kg de proteínas de algas cuesta 10 dólares y la proteína de soja 20 centavos.
BLOOM DE ALGAS Fenómeno que ocurre usualmente en condiciones de alta temperatura, sol y poco oleaje. Bajo este ambiente favorables en nutrientes las algas y cianobacterias crecen rápidamente
Se considera que las algas se encuentran en un bloom (florecimiento) cuando su concentración es del orden de cientos a miles de células por mililitro.
Las concentraciones en un bloom de algas pueden llegar hasta valores de millones de células por mililitro
MAREA ROJA
Es un tipo específico de bloom de algas (específicamente dinoflagelados), con una coloración roja y elevadas concentraciones de toxinas