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• Jorge Sanchez

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LAMMPS DESCARGAR EN WINDOWS Se puede instalar en serie o en paralelo, en paralelo es más rápido el programa, pero necesita de varios procesadores, si se instala en un solo computador, se recomienda instalar en serie, es un poco más lento, pero es seguro para hardware para evitar así el recalentamiento por falta de disipación Descargar en serie la última versión dependiendo si es 32 o 64-bit: http://rpm.lammps.org/windows.html

INSTALACIÓN EN WINDOWS El archivo descargado (lammps-64bit-latest) que es un ejecutable (.exe) se debe llevar a una carpeta especificada por el usuario, y es en esa misma carpeta en donde se debe instalar (especificar la ruta/path cuando se esté instalando) RUNNING Una vez se instala, el programa se debe usar a partir de DOS. Para ello se puede dos rutas:  

Presionar tecla Windows+R Inicio y clikaremos en ejecutar,(en Windows 7 lo escribiremos en el cuadro de búsqueda)

En el cuadro emergente escribir CMD:

Es en este cuadro en el que se realiza la ejecución de lammps. Para realizar la ejecución especificamos la ruta donde se encuentra ubicada la carpeta, entonces vamos a ejecutar uno de los ejemplos Vamos a donde instalamos lammps e ingresamos en la carpeta examples, luego en la colloid y dentro vemos archivos, el que nos interesa es el de nombre in.colloid que es el que va a leer desde DOS.

Cada problema tiene un script de entrada (in.*) y produce un archivo de registro (log.*) y un archivo dump (dump.*) cuando corre. Algunos usan archivos de datos (data.*) para proveer las coordinadas iniciales de las átomos/partículas. El que nos interesa es el archivo dump, para verlo en VMD. En los ejemplos, el archivo in. Se abre como archivo de texto (wordpad o block de notas) para modificarlo (programar) y hay que quitarle en la parte que nombra la palabra dump los comentarios antes de ejecutar para que cree los archivos respectivos, para quitarlos, se abre el archivo in. Y vamos a la parte que dice dump y quitamos los símbolos # y le damos guardar.

Le damos copiar a esa ruta (click derecho, copiar) y nos dirigimos a la ventana de DOS. En esa ventana, cada vez que queramos abrir una carpeta hay que

colocar el comando cd:

Después de cd, damos un espacio, y pegamos nuestra ruta y le damos enter

Aca es donde se ejecuta el archivo in. Colloid, entonces para eso escribimos: lmp_serial –in in.colloid

Le damos enter y empieza a ejecutarse dentro de la mima carpeta colloid,

ABRIR CON VMD Abrimos el programa VMD y se abren 3 ventanas, vamos a la que dice vmd main:

En esa ventana vamos a file, new molecule

Y en la ventana emergente, en la opción determine file type, buscamos lammps trajectory y en browse buscamos nuestro archivo dump generado y le damos load: